更新(xin)時間:2022-06-12
illumina二代測(ce)序(xu)(xu)儀(yi)MiSeq系統可通過各種(zhong)測(ce)序(xu)(xu)應用為您的研究提供便利。它能夠自動(dong)生成雙端read,每(mei)次運行(xing)的產出高達15 Gb,每(mei)條read可提供600多個(ge)堿基的測(ce)序(xu)(xu)數(shu)據。它使(shi)用的文庫(ku)制備試劑盒已(yi)針對多種(zhong)應用進行(xing)了優化,包括靶向基因(yin)測(ce)序(xu)(xu)、小型基因(yin)組測(ce)序(xu)(xu)、擴增子測(ce)序(xu)(xu)、16S宏基因(yin)組學等。
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Illumina公司推出的MiSeq是一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數據分析的新款測序儀,每次運行能產生超過1Gb的數據,且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準確性,讓它成為快速且經濟的遺傳分析的理想平臺,適合廣泛的應用。同時Illumina已被FDA大量采購并即將通過FDA認證,12年10月,MiSeq系統的測序通量已升級至8G左右。升級通過兩個方面完成,一個是cluster密度的增大,升級后cluster密度增加至15-17million,而pair-end讀取的reads數目將會增加至30-34million;另一方面是通過測序讀長而提升通量,測序讀長達到2*300bp,同時測序速度也有所提升。目前,Broad研究院已經利用現有試劑實現了單端測序300bp讀長,Illumina目前內部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些,都是保證在高質量數據結果的前提下完成的。
Illumina MiSeq測序(xu)時間和數據(ju)量(liang)
讀長(chang)(bp) | 時間 | 總數據(ju)量 | Q30 |
1×36 | ~4 hrs | 540-610 Mb | ﹥90% |
2×25 | ~5.5 hrs | 750-850 Mb | ﹥90% |
2×100 | ~16.5 hrs | 3.0-3.4 Gb | ﹥85% |
2×150 | ~24 hrs | 4.5-5.1 Gb | ﹥80% |
2×250 | ~39 hrs | 7.5-8.5 Gb | ﹥70% |
Illumina MiSeq讀取量比(bi)對
運行(xing)類型 | 通過過濾的讀(du)取(百萬(wan)) | |
升級(ji)前 | 升級后 | |
單端讀取(qu) | 5-7 M | 15-17 M |
末端配對(dui)讀(du)取 | 10-14 M | 30-34 M |
illumina二代測序儀 MiSeq四大特性
1、較短的實(shi)驗周期:從(cong)樣品制備開始(shi)需要8小時即可得(de)到超過100M的高質量測序結果。
2、便捷的(de)(de)樣(yang)品制備(bei)流程:需(xu)50ngDNA模板,2小時(shi)的(de)(de)自動化操作(zuo)(zuo)就可以完成(cheng)全部樣(yang)品制備(bei)工作(zuo)(zuo)。
3、測(ce)(ce)序(xu)原理:MiSeq繼續(xu)GA和(he)HiSeq平臺的邊合成邊測(ce)(ce)序(xu)的化學原理。
4、完整的整合(he)功能:MiSeq可以獨立完成(cheng)簇生成(cheng),雙向測序及數(shu)據分析工作,讓經費和實驗室(shi)空(kong)間不再成(cheng)為NGS研究的障(zhang)礙。
illumina二代測序儀 MiSeq應用范圍
1、轉錄組測(ce)序(xu)
派(pai)森諾MiSeq測(ce)序平臺是(shi)基因組已測(ce)序物種(zhong)的轉錄組分析平臺。公司(si)技術(shu)團隊目前已完成了包括(kuo)斑馬魚在內的多種(zhong)植物、動物的轉錄組測(ce)序及(ji)分析。
2、宏(hong)基因組16S rDNA單(dan)V區測序
對(dui)16s rDNA的(de)單V區(V3\V4)進行高通量測序,鑒定(ding)細菌(jun)(jun)群和古(gu)生菌(jun)(jun)群。派森(sen)諾的(de)技術團隊使用(yong)Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區并結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區成功的(de)對(dui)雞的(de)腸道環(huan)境細菌(jun)(jun)進行了鑒定(ding)。
3、Small RNA測序
1*35bp的讀長配合了小RNA的測序長度(du),速度(du)快,靈敏度(du)高。派(pai)森諾的技術團隊目前(qian)已完成了鵝的小RNA測序和(he)多種中草藥的小RNA測序。
4、重測(ce)(ce)序(xu)(xu):包括全(quan)基(ji)因(yin)組(zu)重測(ce)(ce)序(xu)(xu)、簡化基(ji)因(yin)組(zu)測(ce)(ce)序(xu)(xu)、外顯子測(ce)(ce)序(xu)(xu)。
Illumina MiSeq非常適用于(yu)對(dui)微(wei)生物基因組(zu)的重測序,每(mei)次運(yun)行即可完(wan)成一(yi)個(ge)微(wei)生物基因組(zu)測序。2011年(nian)12月27日,派(pai)森諾的技術團(tuan)隊(dui)利用MiSeq一(yi)次運(yun)行同時(shi)(shi)完(wan)成了乳(ru)酸菌(Lactobacillus casei Zhang和(he)Lactobacillus casei P8)的重測序,基因組(zu)覆(fu)蓋深度(du)為(wei)分別為(wei)404倍(bei)和(he)213倍(bei),比對(dui)至(zhi)參考序列(lie),基因組(zu)實現全覆(fu)蓋,同時(shi)(shi)檢(jian)測到(dao)了多種結構變異,包括插(cha)入、缺失和(he)SNP位點,并且檢(jian)測到(dao)了全部質粒(li)。
* 以上(shang)產品介紹(shao)及數據來源于Illumina,僅供參考,以Illumina為準。